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从数据库管理系统角度来看，数据库系统通常采用三级模式结构；这是数据库管理系统内部的系统结构。从数据库最终用户角度看，数据库系统的结构分为单用户结构、主从式结构、分布式结构、客户/服务器、浏览器/应用服务器/数据库服务器多层结构等，这是数据库系统外部的体系结构。
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我知道的就这么多希望能帮到你。
我想我理解的三层也就是
描述层，用HTML等标记语言构建表单及网页格式，结构。
逻辑层，用服务器端脚本解释提交的表单数据，还有用户的特殊需求，然后处理数据，按需将数据整合进标记语言，发给服务器。
数据层，处理文本/数据库的批量数据的储取。
服务器端脚本（例如php，asp，jsp）都是在web服务器上进行逻辑处理。什么传输都是服务器的事情。她接受的是web服务器传给她的表单数据，返回给web服务器的也是服务器能够接受的标记语言。其它无关。
可以有很多种，看你怎么写了，比如三层结构，主目录（项目名目录），里面有iamges,html,js,conn(连接数据库文件如config),data，templates模板文件，admin(后台管理)，等等等。
