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; diff命令在最简单的情况下，比较给定的两个文件的不同。如果使用“-”代替“文件”参数，则要比较的内容将来自标准输入。diff命令是以逐行的方式，比较文本文件的异同处。如果该命令指定进行目录的比较，则将会比较该目录中具有相同文件名的文件，而不会对其子目录文件进行任何比较操作。下面是linuxdiff命令的具体介绍：
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diff(diff即different简写)命令用于比较文件的差异。
选项：
-
-a或——text：diff预设只会逐行比较文本文件;
-b或_ignore-space-change：不检查空格字符的不同;
-B或_ignore-blank-lines：不检查空白行;
-c：显示全部内容，并标出不同之处;
-C
-d或——minimal：使用不同的演算法，以小的单位来做比较;
-D
-e或——ed：此参数的输出格式可用于ed的script文件;
-f或-forward-ed：输出的格式类似ed的script文件，但按照原来文件的顺序来显示不同处;
-H或_speed-large-files：比较大文件时，可加快速度;
-l
-i或_ignore-case：不检查大小写的不同;
-l或——paginate：将结果交由pr程序来分页;
-n或——rcs：将比较结果以RCS的格式来显示;
-N或_new-file：在比较目录时，若文件A仅出现在某个目录中，预设会显示：Onlyin目录，文件A若使用-N参数，则diff会将文件A与一个空白的文件比较;
-p：若比较的文件为C语言的程序码文件时，显示差异所在的函数名称;
-P或_unidirectional-new-file：与-N类似，但只有当第二个目录包含了第一个目录所没有的文件时，才会将这个文件与空白的文件做比较;
-q或_brief仅显示有无差异，不显示详细的信息;
-r或——recursive：比较子目录中的文件;
-s或_report-identical-files：若没有发现任何差异，仍然显示信息;
-S
-t或_expand-tabs：在输出时，将tab字符展开;
-T或_initial-tab：在每行前面加上tab字符以便对齐;
-u，-U
-v或——version：显示版本信息;
-w或_ignore-all-space：忽略全部的空格字符;
-W
-x
-X
-y或_side-by-side：以并列的方式显示文件的异同之处;
_help：显示帮助;
_left-column：在使用-y参数时，若两个文件某一行内容相同，则仅在左侧的栏位显示该行内容;
_suppress-common-lines：在使用-y参数时，仅显示不同之处。
以上就是今天的分享了，希望可以帮助到大家。
本文章基于thinkpadE15品牌、centos7系统撰写的。
在Unix/Linux下，高效工作方式不是操作图形页面，而是命令行操作，命令行意味着更容易自动化。使用过Linux系统的朋友应该都知道它的命令行强大之处。话说回来了，以下这些命令使用技巧你又知道多少呢？
1、Vim自动添加注释及智能换行
# vi ~/.vimrc set autoindentset tabstop=4set shiftwidth=4function AddTitle()call setline(1,"#!/bin/bash")call append(1,"#====================================================")call append(2,"# Author: lizhenliang")call append(3,"# Create Date: " . strftime("%Y-%m-%d"))call append(4,"# Description: ")call append(5,"#====================================================")endfmap F4 :call AddTitle()cr
打开文件后，按F4就会自动添加注释，省了不少时间：
2、查找并删除/data这个目录7天前创建的文件
# find /data -ctime +7 -exec rm -rf {} \;# find /data -ctime +7 | xargs rm -rf
3、tar命令压缩排除某个目录
# tar zcvf data.tar.gz /data --exclude=tmp #--exclude参数为不包含某个目录或文件，后面也可以跟多个
4、查看tar包存档文件，不解压
# tar tf data.tar.gz #t是列出存档文件目录，f是指定存档文件
5、使用stat命令查看一个文件的属性
访问时间（Access）、修改时间（modify）、状态改变时间（Change）stat index.phpAccess: 2018-05-10 02:37:44.169014602 -0500Modify: 2018-05-09 10:53:14.395999032 -0400Change: 2018-05-09 10:53:38.855999002 -0400
6、批量解压tar.gz
方法1：# find . -name "*.tar.gz" -exec tar zxf {} \;方法2：# for tar in *.tar.gz; do tar zxvf $tar; done方法3：# ls *.tar.gz | xargs -i tar zxvf {}
7、筛除出文件中的注释和空格
方法1：# grep -v "^#" httpd.conf |grep -v "^$"方法2：# sed -e ‘/^$/d’ -e ‘/^#/d’ httpd.conf http.conf或者# sed -e '/^#/d;/^$/d' #-e 执行多条sed命令方法3：# awk '/^[^#]/|/"^$"' httpd.conf 或者# awk '!/^#|^$/' httpd.conf
8、筛选/etc/passwd文件中所有的用户
方法1：# cat /etc/passwd |cut -d: -f1方法2：# awk -F ":" '{print $1}' /etc/passwd
9、iptables网站跳转
先开启路由转发：echo "1" /proc/sys/net/ipv4/ip_forward #临时生效内网访问外网（SNAT）：iptables –t nat -A POSTROUTING -s [内网IP或网段] -j SNAT --to [公网IP]#内网服务器要指向防火墙内网IP为网关公网访问内网（DNAT）（公网端口映射内网端口）：iptables –t nat -A PREROUTING -d [对外IP] -p tcp --dport [对外端口] -j DNAT --to [内网IP:内网端口]#内网服务器要配置防火墙内网IP为网关，否则数据包回不来。另外，这里不用配置SNAT，因为系统服务会根据数据包来源再返回去。
10、iptables将本机80端口转发到本地8080端口
# iptables -t nat -A PREROUTING -p tcp --dport 80 -j REDIRECT --to-ports 8080
11、find命令查找文件并复制到/opt目录
方法1：# find /etc -name httpd.conf -exec cp -rf {} /opt/ \;: #-exec执行后面命令，{}代表前面输出的结果，\;结束命令方法2：# find /etc -name httpd.conf |xargs -i cp {} /opt #-i表示输出的结果由{}代替
12、查看根目录下大于1G的文件
# find / -size +1024M 默认单位是b，可以使用其他单位如，C、K、M
13、查看服务器IP连接数
# netstat -tun | awk '{print $5}' | cut -d: -f1 |sort | uniq -c | sort -n -tun：-tu是显示tcp和udp连接，n是以IP地址显示cut -d：-f1：cut是一个选择性显示一行的内容命令，-d指定：为分隔符，-f1显示分隔符后的第一个字段。uniq -c：报告或删除文中的重复行，-c在输出行前面加上出现的次数sort -n：根据不同类型进行排序，默认排序是升序，-r参数改为降序，-n是根据数值的大小进行排序
14、插入一行到391行，包括特殊符号"/"
# sed -i "391 s/^/AddType application\/x-httpd-php .php .html/" httpd.conf
15、列出nginx日志访问最多的10个IP
方法1：# awk '{print $1}' access.log |sort |uniq -c|sort -nr |head -n 10sort ：排序uniq -c：合并重复行，并记录重复次数sort -nr ：按照数字进行降序排序方法2：# awk '{a[$1]++}END{for(v in a)print v,a[v] |"sort -k2 -nr |head -10"}' access.log
16、显示nginx日志一天访问量最多的前10位IP
# awk '$4="[16/May/2017:00:00:01" $4="[16/May/2017:23:59:59"' access_test.log |sort |uniq -c |sort-nr |head -n 10# awk '$4="[16/Oct/2017:00:00:01" $4="[16/Oct/2017:23:59:59"{a[$1]++}END{for(i in a){print a[i],i|"sort -k1 -nr |head -n 10"}}' access.log
17、获取当前时间前一分钟日志访问量
# date=`date +%d/%b/%Y:%H:%M --date="-1 minute"` ; awk -vd=$date '$0~d{c++}END{print c}' access.log# date=`date +%d/%b/%Y:%H:%M --date="-1 minute"`; awk -vd=$date '$4="["d":00" $4="["d":59"{c++}END{print c}' access.log # grep `date +%d/%b/%Y:%H:%M --date="-1 minute"` access.log |awk 'END{print NR}'# start_time=`date +%d/%b/%Y:%H:%M:%S --date="-5 minute"`;end_time=`date +%d/%b/%Y:%H:%M:%S`;awk -vstart_time="[$start_time" -vend_time="[$end_time" '$4=start_time $4=end_time{count++}END{print count}' access.log
18、找出1-255之间的整数
方法1：# ifconfig |grep -o '[0-9]\+' #+号匹配前一个字符一次或多次方法2：# ifconfig |egrep -o '\([1-9]|[1-9][0-9]|1[0-9][0-9]|2[0-4][0-9]|25[0-5])\'
19、找出IP地址
# ifconfig |grep -o '[0-9]\{1,3\}\.[0-9]\{1,3\}\.[0-9]\{1,3\}\.[0-9]\{1,3\}' #-o只显示匹配字符
20、给文档增加开头和结尾说明信息
# awk ‘BEGIN{print "开头显示信息"}{print $1,$NF} END{print "结尾显示信息"}’/etc/passwd# awk 'BEGIN{printf " date ip\n------------------\n"} {print $3,$4} END{printf "------------------\nend...\n"}' /var/log/messages date ip------------------03:13:01 localhost10:51:45 localhost------------------end...
21、查看网络状态命令
# netstat -antp #查看所有网络连接# netstat -lntp #只查看监听的端口信息# lsof -p pid #查看进程打开的文件句柄# lsof -i:80 #查看端口被哪个进程占用
22、生成8位随机字符串
方法1：# echo $RANDOM |md5sum |cut -c 1-8方法2：# openssl rand -base64 4方法3：# cat /proc/sys/kernel/random/uuid | cut -c 1-8
23、while死循环
while true; do #条件精确等于真，也可以直接用条件[ "1" == "1" ]，条件一直为真ping -c 2
24.awk格式化输出
将文本列进行左对齐或右对齐。
左对齐：# awk '{printf "%-15s %-10s %-20s\n",$1,$2,$3}' test.txt右对齐：# awk '{printf "%15s %10s %20s\n",$1,$2,$3}' test.txt
25.整数运算保留小数点
方法1：# echo 'scale=2; 10/3;'|bc #scale参数代表取小数点位数方法2：# awk BEGIN'{printf "%.2f\n",10/3}'
26.数字求和
# cat a.txt10235356方法1：#!/bin/bashwhile read num;dosum=`expr $sum + $num`done a.txtecho $sum方法2：# cat a.txt |awk '{sum+=$1}END{print sum}'
27、判断是否为数字（字符串判断也如此）
# [[ $num =~ ^[0-9]+$ ]] echo yes || echo no #[[]]比[]更加通用，支持模式匹配=~和字符串比较使用通配符`^ $：从开始到结束是数字才满足条件=~：一个操作符，表示左边是否满足右边（作为一个模式）正则表达式
28、删除换行符并将空格替换别的字符
# cat a.txt |xargs echo -n |sed 's/[ ]/|/g' #-n 不换行# cat a.txt |tr -d '\n' #删除换行符
29、查看文本中20至30行内容（总共100行）
方法1：# awk '{if(NR 20 NR 31) print $0}' test.txt方法2：# sed -n '20,30p' test.txt 方法3：# head -30 test.txt |tail
30、文本中两列位置替换
# cat a.txt60.35.1.15 awk '{print $2"\t"$1}' a.txt
在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令：
通过多敲键盘，形成手感 肌肉记忆 ，熟练掌握这些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍（主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记）
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来：
参数的用法介绍：
注意事项：
用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 编辑文本 ，编辑文本要加 符号，退出时，另起一行，按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件，tac逆向查看
结合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默认 10 行 （在R语言里head和tail默认是前6行）。
less命令用得最多 ，more命令用得比较少
3.1 less命令
less [参数] 文件名
less命令重要的补充用法1 ：
需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q键
less命令重要的补充用法2 ：
参数用法：
less命令 不加参数 查看文件：
less命令加 -N参数 查看文件：显示行号
less命令加 -S参数 查看文件：单行显示，非常规整
对比：less和cat命令显示文本行号的用法：less -N，cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐页查看，按空格翻页，按回车换行 ，more命令一般很少用，熟练掌握less命令就好
查看压缩文件
wc 统计字符是也把换行符统计进去，但是别的命令不一定会把换行符算进去，。
常见参数:
切记：用less命令，按q退出
cut命令是按关键词来切的
常见参数:
排列前：
排列后：
解释：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。
命令行查看一个表格结构时，因为制表符对齐的原因，出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样，所以 加上-n参数 ， 让数值有数学意义上的大小来排序 。
uniq命令去重，只有两行出现重复，而且是相邻的两行，如果不相邻，即使出现两行一模一样，不会去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
换其它文件试试
总之，uniq命令使用时经常和sort一起
常见参数:
常见用法1：
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常见用法2 : paste - -
常见参数:
要养成一个好习惯，原始数据不要轻易修改，修改的东西另外保存，文本保存用 (重定向)或是 (追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符传递给 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容
3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列
4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计
5. 在第4步的基础上，将空格替换成制表符
补充小知识 ：
清屏 ：control L
查看历史（输入过的）命令 ：history
sda3 不是逻辑分区，扩展分区没对齐没事。真正存储数据的是逻辑分区，不是扩展分区。
所以sda5 和 sda6 对齐了就行了。
当然， sda3 能对齐当然更好了。
