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define('MAX_SLEEP_TIME',120);
$hostname="localhost";
$username="root";
$password="password";
$connect=mysql_connect($hostname,$username,$password);
$result=mysql_query("SHOWPROCESSLIST",$connect);
while($proc=mysql_fetch_assoc($result)){
if($proc["Command"]=="Sleep"&&$proc["Time"]>MAX_SLEEP_TIME){
@mysql_query("KILL".$proc["Id"],$connect);
}
}
mysql_close($connect);
?>

将它当中的$password改成你实际的数据库密码，死连接的时间也可以修改。然后加入计划任务就可以了。比如用crontab-e命令加入：

*/2****php/usr/local/sbin/kill-mysql-sleep-proc.php

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